由于论文需要，需要可视化一个双层的网络图，因此去网上寻找如何用gephi绘制多层的网络图，但是大部分的双层网络图绘制教程并未给出详细全面的教程，导致并不能得到想要的图片，本文在此基础上记录了自己的实验教程
软件准备：Gephi
插件准备：Isometric Layout （3D化网络图）， Give Colors To Nodes（节点的颜色）， Give Colors To Edges（边的颜色），Polygon Shaped Nodes（形状）
步骤：
1、插件下载（仅举Isometric Layout 一个例子，其他的如下）
2、下载完成之后重启激活插件
3、数据准备
节点表：节点表中必须添加各种属性列，如下是我准备的一个节点表，其中color是节点颜色属性，Polygon是形状属性（0代表圆形，3代表三角形，4代表四边形，按照规律依次5就是五边形……），[z]代表是多层网络的第几层（注意：z必须要有“[]”不然识别不了）
边表：type列用于设置是否为有向（有向：directed 无向：undirected），color用于设置边的颜色（建议与节点颜色一致，异质节点间用另外的颜色），边表中的属性因为以论文和作者为例，因为其中论文与论文之间是引用关系有方向，研究人员之间的合作无向
4、导入数据
找到我们刚才保存好的节点表格打开
此时导入并不能正常显示中文，因此还需要设置字符编码
设置之后就能正常显示中文
点击下一步
点击完成
因为我们是混合的图（既包含有向又包含无向）因此图的类型选择有向，新的工作区，点击确定成功导入节点图，边列表也遵循上述步骤，不同的是边需要加入现有工作区，如下图：
点击确定，导入成功
节点颜色显示方法如下：
点击应用，节点颜色正常显示
绘制多层
布局上选择Isometric Layout，
修改三个参数，其中第一个参数Z-Maximum Level代表多少层，本案例中为2层
Z-Distance代表两层之间的距离，Scale代表图的整体大小，如果节点很多就将这个参数调大节点才能分开，如果节点不多则不需要调整，下面两个参数都是旋转图所用的，按需调整，参数设置好之后点击运行
为节点再安排一个按照度的大小
设置好最大最小，点击应用
最后，点击预览
依次设置左侧属性
可以参照我的参数设置，点击刷新，如下图所示：
标签并未显示在节点上方，是因为某个插件下载后的原因，继续点击管理渲染器，将缺省节点标签提到最上方，点击刷新
最后就能呈现出双层的网络图了。由于数据并不是很好，所以效果可能不是那么好，以下有我以前做过的效果图：
供大家参考
参考文献：
Gephi| 改变节点形状 - 简书 (jianshu.com)
Gephi | 共现网络使用自己固定的颜色 - 简书 (jianshu.com)
如何在Gephi中可视化多层网络_gephi多层网络-CSDN博客
操作指南 | 如何绘制多层网络(Multiplex Networks)!_哔哩哔哩_bilibili